Сюжет развивается после появления данных о загадочном объекте, обладающем искусственным происхождением и представляющем собой сложного клона с уникальными способностями к маскировке и смене облика. Этот Зэд Гриссом, ранее считавшийся одним из самых опасных, неожиданно оказывается связан с корпорацией, занимающейся незаконным клонированием и нарушениями закона. Обнаружение фактов о его создании и утрате контроля над ним порождает новые вызовы для героев. Поиски Гриссома и попытки выяснить детали его функций приводят к взаимодействию с аналитиками, косвенным раскрытиям корпоративных интриг и новым информационным потокам, балансирующим между открытием истины и риском распространения опасных сведений.

Усложняет ситуацию недостаток достоверной технической информации о Зэде, что препятствует быстрому решению задачи по его нейтрализации. Кроме того, постоянное присутствие прессы и вмешательство журналистки требуют осторожности в работе, чтобы не нанести ущерб деятельности Гвардии. Внешние обстоятельства, такие как взрыв в лаборатории, потеря большого числа квалифицированных сотрудников и собственно технологическая неизвестность, связанная с биологией клона, создают значительные препятствия. Герою приходится лавировать между требованиями начальства, выполнением служебного долга и отображением реальных событий, скрывая при этом детали от посторонних.

Решения, к которым приходит Соболевский, заключаются в системной работе с экспертами и анализе информации, выстраивании сотрудничества с заинтересованными сторонами и поиске способов ограничения ущерба от возможных раскрытий. Постоянное наблюдение за Гриссом, тщательное изучение обстоятельств его появления и подготовка к возможным конфликтам становятся частью нового режима, в котором находятся силы безопасности. В контексте этого процесса возникает дилемма касательно баланса между необходимостью обнародования фактов и сохранением контроля над ситуацией, что становится одной из основных тем истории.

В итоге развитие конфликта поднимает вопросы ответственности, контроля над созданными технологиями и возможных последствий деятельности тайных структур. Центральной для сюжета остаётся задача предотвращения повторения страшных событий прошлого, а также поддержание стабильности в условиях постоянных угроз и информационной неопределённости. Эти обстоятельства формируют основу для будущих решений и действий героев в меняющемся мире. В таком ключе формируется сюжет Хроники Третьего Кризиса, автором которой является Сергей Мусаниф.