По мере развития сюжета ситуация усложняется постоянным наблюдением за доктором Тихорецкой и её действиями, а также растущей неразберихой в действиях Сергея, который пытается найти объяснение своим подозрениям и опасениям. Проблемы возникают как из внешних обстоятельств — преследований и слежки, так и из внутренних конфликтов персонажей, связанных с доверием и прошлым. Возникает дилемма между соблюдением строгой дисциплины и необходимостью доверять непредсказуемым людям, чья информированность может оказаться опасной.

В таких условиях герою приходится выстраивать отношения с окружающими, делая выбор между разными стратегиями поведения. Он сталкивается с препятствиями как от внешних сил, так и из-за неопределённости в собственных ощущениях и воспоминаниях. Его решения влияют на ход расследования и раскрытие тайн, связанных с убийством и комплексом тайн вокруг объекта «А». Развитие конфликта ведёт к усилению контроля и напряжённости в отношениях между персонажами, а также к переосмыслению места героя в происходящих событиях.

В центре сюжета остаётся вопрос доверия, информированности и способности прогнозировать поведение человека вне установленной системы. Основная тема связана с поиском баланса между секретностью и необходимостью расширенного знания, а также с выявлением истинных мотивов и намерений участников событий. Таким образом, конфликт строится на столкновении профессионализма и непредсказуемости, секретности и открытости, что определяет дальнейшие действия и судьбу главных героев в книге Херувим. Том 2, написанной Полиной Дашковой.