Сложности с поиском и расшифровкой информации усугубляются тем, что часть документальных материалов утрачена или находится в руках различных заинтересованных лиц. Героям приходится обращаться к разнообразным источникам, в том числе к тридцатитомнику, где скрыты подсказки и записи, сделанные прежде, чем рукопись пропала. Постоянное перемешивание воспоминаний, ассоциаций и реальных данных ставит перед персонажами дилемму: как и где искать недостающие фрагменты, кому доверять и как избежать очередных потерь.

Внутренние ограничения, такие как болезни, смерть и личные трагедии, влияют на ход событий. Так, смерть Морозова вносит эмоциональный и организационный разлад, а забота о наследниках и близких добавляет к проблемам новые обязанности и ограничения по времени. В этих условиях Николас и его окружение принимают решения, направленные на сохранение рукописи и контроль над её дальнейшей судьбой, что требует умения балансировать между коммерческими интересами, культурной значимостью и моральными соображениями.

Развитие конфликта ведёт к обсуждению вариантов издания произведения, распространения прав на экранизацию и театральные постановки, что подчёркивает масштаб и сложность задачи. Главная тема остаётся вокруг выбора: сохранить рукопись как культурное наследие или использовать её для создания имиджа и финансовой выгоды, при этом вопрос о полной сохранности текста и его подлинности остаётся открытым. Эта дилемма задаёт направление сюжету и формирует основу для дальнейших решений и действий главных героев. В центре внимания — поиски, сохранение и использование уникального литературного объекта, вокруг которого разворачиваются личные и профессиональные противостояния.

Так выстраивается каркас истории, раскрывающейся в книге Бориса Акунина под названием Ф. М. Том 2.