Развитие сюжета связано с попытками Фернана расследовать дело о преступниках, чьи обвинения противоречивы и многогранны, что осложняется вмешательством религиозных фигур и тайными знаниями, которыми они обладают и не спешат раскрывать. Ситуация усложняется из-за напряжённости между различными властными структурами, недоверием к контрразведке и опасениями относительно последствий раскрытия тайн. Помимо официальных расследований, Ферну приходится учитывать легенды и предания, связанные с опасными колдунами и воинами, что добавляет мистический и непредсказуемый элемент к его миссии.

Перед героем встаёт сложный выбор между соблюдением установленных правил и необходимостью принимать нестандартные решения для защиты интересов государства и невиновных. Ограничения, наложенные церковной и светской властью, а также присутствие скрытых сил и интриг заставляют маркиза искать нестандартные пути решения и налаживать нежелательные, но необходимые связи. Вмешательство в судьбы заключённых, взаимодействие с разными слоями общества, а также опасность раскрытия секретов создают для него постоянное давление и необходимость балансировать между долгом и личными убеждениями.

Итогом событий становится сохранение иерархического порядка и предотвращение подрывных действий в армии и государстве, но при этом остаётся открытым вопрос дальнейшей роли главного героя и его отношения с властью и церковью. Центральной для сюжета является дилемма сохранения баланса между честью, верностью власти и личной ответственностью перед вызывающими сомнения тайнами и предательствами. Такая ситуация требует от Фернана постоянного выбора между долгом и сложившимися обстоятельствами, что остаётся ключевой темой произведения Под знаком мантикоры, автором которого выступил Алексей Юрьевич Пехов.