Сложность ситуации увеличивается, когда становится ясно, что поступают новые, более опасные вызовы, и старые методы не всегда работают. На пути возникают предпосылки для конфликтов между различными сторонами, а также необходимость переосмысления роли инквизиции и лично Клавдия. Ограничения деятельности, жесткость системы и неоднозначность результатов расследований создают рамки выбора и влияют на действия главного героя. Он должен балансировать между требованием долга и пониманием тех, кого пытается контролировать.

Решения, которые приходится принимать Клавдию, включают выбор между строгими методами и поиском более гибких подходов, а также умение обращаться с разными типами ведьм и оценивать реальную угрозу. Это отражается и в отношениях с другими персонажами, включая Ивгу и прочих, чьи судьбы переплетаются с его деятельностью. Итогом развития конфликта становится состояние, в котором не исчезает основная дилемма: как сохранить порядок и безопасность, не потеряв человечности и способности видеть сложность ситуации. Центральной задачей остаётся выстраивание баланса между властью, страхом и свободой в мире, где ведьмы и инквизиторы находятся в постоянном напряжении.

Такова общая структура повествования, раскрывающая ключевые события и внутренние конфликты без подробного хронологического изложения, дающая представление о главных проблемах и задачах, заложенных в произведении Марина и Сергей Дяченко под названием Ведьмин век.