Сложность ситуации растёт из-за множества внешних факторов — войны, предательства, измены в окружении, и внутренние конфликты, вызванные борьбой за власть и стремлением сохранить жизнь. Герой сталкивается не только с опасностью физической смерти, но и с необходимостью сохранять контроль над собственным положением, используя знания и умение влиять на события. В этом контексте ему приходится принимать необычные решения, рисковать и идти на хитрости, чтобы установить хотя бы временное преимущество.

Определённые моменты повествования показывают, как персонаж пытается использовать своё понимание истории и ситуации для выстраивания тактики выживания. Он разрабатывает план действий, который предусматривает обман и внезапные атаки, пытаясь тем самым переломить ход конфликта и сохранить себя и своих людей. В конечном итоге развитие сюжета приводит к тому, что главный герой оказывается перед выбором между продолжением борьбы и сохранением жизни в условиях практически безвыходного положения.

Главная тема сохраняется в осознании того, что знания о будущем и прошлое не гарантируют успех, а правильные решения нередко связаны с риском и моральными дилеммами. Задача героя — найти путь к выживанию и возможности изменить ход истории, несмотря на натиск врагов и ограниченные ресурсы. Сюжет ставит перед ним и читателем вопросы о цене власти, необходимости хитрости и терпения в условиях кризиса, а также о том, какой путь выбрать между поражением и спасением. В книге Иван Алексин подробно раскрывает эти аспекты через развитие событий и характеры действующих лиц в период исторической нестабильности. Федор Годунов. Потом и кровью иллюстрирует борьбу человека, оказавшегося в самом центре сложных перемен и угроз, где каждый шаг может привести как к гибели, так и к временному успеху.