Начало сюжета связано с тем, что в гимназии возникают странности — от неожиданных визитов и подозрительных шагов в коридорах до изменений в документах и исчезновений заметок, важных для понимания ситуации. Эти события нарушают привычный порядок, заставляя главных героев быстрей реагировать и искать информацию в архивах, газетах и зашифрованных карточках. Главные участники пытаются связать произошедшие факты с давно забытыми и почти легендарными событиями, в частности, с фигурой Кузара — ментального мага, которого подозревают в попытках вызвать переворот и который исчез после своих действий в прошлом.

По мере развития сюжета обстановка осложняется тем, что доступ к информации становится проблематичным, некоторые документы оказались удалены или подделаны, а присутствуют и неизвестные силы, которые препятствуют попыткам выяснить правду. В этих условиях Алекс и его коллеги вынуждены принимать решения, связанные с тайнами прошлого и их воздействием на настоящее. Они обращаются к разным источникам, ведут своё собственное расследование, сталкиваясь при этом с внутренними сомнениями и внешними препятствиями в виде традиций, недоверия и магических ограничений.

В результате развертывающихся событий герои приходят к пониманию, что вопрос касается не только текущего положения дел в гимназии и городе, но и более масштабной задачи — понять присутствие и влияние Кузара, а также предотвратить возможные последствия его возвращения или действий тех, кто идёт его следами. Основной конфликт сосредоточен вокруг необходимости выяснить истинные мотивы и опасности, стоящие за недавними происшествиями, а также найти баланс между сохранением порядка и раскрытием скрытых тайн.

В Китеже. Возвращение Кузара. Часть 2 от Марты Зилановой сосредоточена на показе столкновения повседневной жизни учеников и тайных магических интриг, где амбиции, страхи и обязанности переплетаются в сюжет, основанный на поисках правды и выборе между безопасностью и риском.