Ситуация меняется с получением письма с подтверждением признания магии тонких потоков и полномочиями на преподавание. Эта перемена запускает активные действия по созданию учебной базы: выбор помещения, планирование учебных и административных комнат, подготовка сметы на ремонт. Параллельно появляются сложности, связанные с противодействием со стороны старой гвардии медицины — Захарьина и Гааза, чье неприязненное отношение и влияние осложняют продвижение проекта. Обухов, главный лекарь Петербурга, выступает союзником Склифосовского, оказывая поддержку и давая советы по преодолению препятствий.

Дополнительные проблемы формируются вокруг необходимости соответствия учебного заведения высоким стандартам, чтобы привлечь внимание общественности и добиться признания. Возникают вопросы о правильном распределении помещений для теории и практики, обеспечении комфортных условий для преподавателей и студентов, организации палаты для круглосуточного пребывания и оборудования для хранения лекарств. Каждое из этих решений требует времени, ресурсов и значительных усилий. Внутренние препятствия проявляются также в необходимости составления и подачи отчётов, а внешние — через бюрократические препоны и скрытое противодействие влиятельных фигур.

В развитии сюжета формируется динамика противостояния между стремлением к прогрессу и консерватизмом существующих структур. Склифосовскому приходится не только заниматься текущими организационными вопросами, но и бороться за право внедрять инновации, используя поддержку влиятельных союзников и находя способы обходить попытки заблокировать его деятельность. Принятие сметы и подготовка к ремонту учебного заведения становятся символами продвижения проекта, хотя и сопровождаются необходимостью выдерживать давление и конфликты.

Главная тема сохраняет центр тяжести на противостоянии инновационного подхода в медицине с традиционными представлениями и страхами перед изменениями. Задача Склифосовского — не только обучить лекарей новой методике, но и пробиться сквозь институциональные и личностные препятствия, сохраняя мотивацию и настойчивость. Формируется дилемма между необходимостью быстро действовать и требованиями соблюдения формальностей, между желанием развивать медицину и вызовами, которые несут изменения. Вся история концентрируется на усилении противоречий и поиске решений в условиях давления, демонстрируя сложности реформирования устоявшейся системы. Таким образом строится повествование, в котором развитие медицинской методики становится условием преодоления конфликтов и перемен как в профессиональной среде, так и во внутреннем состоянии героя. Правильный лекарь. Том 5 написан Сергеем Измайловым и представляет продолжение истории, связанной с внедрением новых знаний и практик в медицинское образование и деятельность.