В основе сюжета лежит ситуация, когда молодой человек оказывается в сложных обстоятельствах из-за особой магической способности, воспринимаемой его окружением как порок и позор рода. После процедуры Пробуждения у него проявляется сила ртути, что в семье Ломоносовых считается самым низким и нежелательным видом магии. Вместо того чтобы быть наследником могучей алхимической линии с силой золота, он вынужден принять жестокий выбор: обречь себя на год ссылки в запущенную усадьбу, окружённую опасностями, или пройти процедуру Избавления, которая могла бы полностью лишить его магии. Это решение становится отправной точкой для дальнейших событий и конфликтов. Главный герой, имеющий имя Илья Ломоносов, испытывает внутреннее сопротивление своей новой роли. Он ненавидит алхимию, которая блокирует его собственную магическую силу и ведёт к отчуждению от родных и окружения. Несмотря на это, он вынужден освоить то, что раньше презирал, чтобы хоть как-то выжить и попытаться сохранить свою личную магию. Находясь под строгим контролем семьи и общества, он сталкивается с неприятием и даже враждебностью. Сельские жители относятся к нему с ненавистью и презрением, усиливая чувство одиночества и недоверия, которое охватывает Илью. Во время ссылки ему приходится учиться взаимодействовать с новым миром — природой, таинственными и опасными местами, а также магическими существами, нападающими на близлежащие поселения.

Эти встречи и испытания ставят перед ним задачи, которые требуют не только приобретения новых знаний, но и ответственности за окружающих. Дополнительные трудности создают отношения внутри семьи и с ближайшим окружением: недоверие к охране, друзьям, даже к своей сестре и няне. Герою приходится балансировать между собственной неприязнью к алхимии и необходимостью использовать её в бою и защите. Кроме того, развивается линия с другими персонажами, которые, как и он, имеют свои тайны и подвохи, что осложняет взаимодействие и заставляет Илью постоянно держать оборону не только внешнюю, но и внутреннюю. По мере продвижения сюжета он совершает выбор, который влияет на его судьбу и положение в мире, демонстрируя сложность компромиссов между свободой, безопасностью и самореализацией. Главным вопросом становится дилемма, связанная с отторжением собственной магии и необходимостью принимать то, что даёт жизнь, равно как и решать, чему отдать предпочтение — раз и навсегда отказаться от алхимии или научиться сосуществовать с ней ради достижения собственных целей. Этот конфликт отражает центральную задачу героя, которая определяет развитие и характер повествования. Все вышеперечисленное формирует основу произведения Государственный Алхимик автора А. Райро, раскрывая тему борьбы с наследием, самоопределения и сложных отношений с магией в непростом мире.