Развитие повествования связано с рассмотрением широкого спектра факторов, влияющих на поведение: сенсорные сигналы из окружающей среды, гормональные реакции, генетика и культурные нормы. Особое внимание уделяется тому, как мозг реагирует на стимулы в разные моменты и как это влияет на выбор действий. Сложность исследования усугубляется тем, что поведение нельзя упростить до воздействия одного фактора или объяснить только одной дисциплиной. Приматы и другие животные рассматриваются как модели, дающие ключ к пониманию универсальных и специфичных видов реакции и взаимодействия.

В книге анализируются препятствия в изучении поведения, включая идеологические разногласия между биологами и социальными учёными, а также вызовы, связанные с многоаспектностью и временной глубиной изучаемых процессов. Рассматриваются механизмы формирования привычек через оперантное обучение, а также различия между врождёнными и приобретёнными чертами, что помогает лучше понять человеческую непредсказуемость и вариативность поведения. Герою, выступающему в роли учёного, приходится принимать во внимание множество взаимосвязанных переменных, искать баланс между биологией и социокультурными влияниями.

В итоговом счёте развитие темы приводит к пониманию того, что для разъяснения природы добра и зла в человеческом поведении необходимо учитывать как краткосрочные ситуации и непосредственные стимулы, так и долгосрочные эволюционные и культурные контексты. База каждого поступка находится в сложном сплетении биологических, психологических и социальных факторов, которые не разделимы друг от друга. Главной дилеммой остаётся вопрос о том, как объединить эти разные уровни анализа для целостного понимания человеческой природы и того, что движет нашими поступками в самых разнообразных ситуациях. В итоге выясняется, что поведение не может быть объяснено упрощённо, и для его изучения необходим междисциплинарный и многоплановый подход. В книге Биология добра и зла. Как наука объясняет наши поступки изложен такой взгляд, основанный на разнообразных научных данных и наблюдениях.