В основе сюжета лежит напряжённая политическая и интеллектуальная атмосфера Лондона конца XVII века, где влиятельные лица постоянно находятся в состоянии взаимного наблюдения и скрытой борьбы. В этом окружении развивается история, в которой перемены и тревоги сведены как в публичной жизни, так и в частных судьбах. Главным центром событий становится доктор Даниель Уотерхауз, вынужденный покинуть привычную академическую среду Кембриджа и обосноваться в Лондоне. Его роль складывается не столько из высоких научных заслуг, сколько из заботы о человеке, чьё имя имеет историческую значимость — Исааке Ньютоне. Даниель ухаживает за ним и сопровождает в последние годы жизни, пытаясь сократить дистанцию между миром естественных наук и религиозными догмами, в которых Ньютон погружается.

Однако привычный порядок нарушается не только болезненными обстоятельствами. Обстановка осложняется неожиданными политическими интригами, в которых задействованы влиятельные фигуры и тайные общества. Эпохальные перемены отражаются в смене руководства Королевского общества и в напряжённости между отечественными и европейскими учёными, которые оказывают давление на окружающих и меняют баланс сил. Внутренние конфликты персонажей связаны с долгами, недоверием и тайнами, а также с необходимостью принимать решения под давлением обстоятельств и властных структур. В частности, забота о Ньютоне осложняется борьбой между научной честностью и политическими махинациями, связанной с перепиской, шифрами и чувствительными научными открытиями того времени....