Нарушением привычного порядка становится появление информации о предательских действиях и планах устранения самого командира, что запускает цепочку экстренных мер и расследований. В центре внимания оказывается персонаж, вынужденный противостоять не только врагам на поле боя, но и скрытым врагам внутри собственной организации. Ситуация усложняется необходимостью добыть ключевые сведения без задержек и без глубокого погружения в бюрократию, что ведёт к применению нестандартных и жёстких методов.

Основные события развиваются вокруг расследования и выявления источников подозрений и заговоров, а также проведения военных операций по уничтожению или захвату вражеских судов и объектов в прибрежных зонах. Горизонты действия охватывают морские сражения, тактические манёвры, столкновения с партиями враждебных агентов и демонстрации решимости сохранить контроль и инициативу. Важную роль играют также переговоры и политические интриги, влияющие на оперативные решения.

В середине повествования усложнения связаны с усилением внутреннего давления на главного героя, проявляющегося в угрозах, необходимости принимать ответственные решения без возможности полноценного обсуждения и сжатые сроки для реакции на вызовы. Он сталкивается с дилеммами между сохранением моральных принципов и необходимостью применять жёсткие меры ради общей безопасности. Внешние обстоятельства постоянно меняются, а ситуация становится менее предсказуемой, подталкивая к выбору между различными стратегиями действия.

Герой принимает решения, позволяющие удерживать ситуацию под контролем, включая одновременное применение боевых операций и проведение оперативных следственных мероприятий. Последствия таких решений отражаются в сохранении части флота и получении информации, важной для дальнейших действий. Вместе с тем сохраняется риск новых потерь и продолжающегося давления со стороны как внешних, так и внутренних врагов.

Развитие конфликта в книге строится вокруг главной задачи сохранить боеспособность, раскрыть предательство и удержать инициативу в условиях войны и политического напряжения. Создавая комплексное изображение положения на фронте и в командовании, произведение ставит в центр внимания дилеммы лидерства, обязанности и способов достижения безопасности без привлечения официальных судебных процедур и с учётом боевых реалий. Все эти аспекты формируют основу сюжета «Все по местам!» Возвращение «Варяга» Глеба Борисовича Дойникова.