Сложности возникают из-за неоднозначного понимания сущего, так как под этим понятием скрываются разные значения и категории, требующие отдельного рассмотрения. Внутренние проблемы в ходе исследования связаны с необходимостью разрешить противоречия и определить, что именно должно служить первым началом. Это приводит к детальному разбору понятий формы, материи, начала движения и цели как первых причин существования и изменения вещей. Решения, принимаемые в процессе, направлены на установление определенности в понимании сущности и связей между причинами, что также затрагивает вопросы относительности знания и его основных законов, таких как закон противоречия.

Развитие конфликта отражается в поиске научного основания, которое объединит различные виды знания и позволит исследовать сущее как таковое без опоры на частные понятия и чувственные данные. Полагая первой философией науку, изучающую именно неподвижное и самодостаточное, философ задает методологические принципы, направленные на постижение сущности и первичных начал. Итогом служит формулирование понимания философии как науки о едином и целом бытии, с акцентом на раскрытие общих начал и причин, позволяющих строить последовательное и непротиворечивое познание. Главная тема, остающаяся центральной, — это определение сущего и поиск основания для всякого знания о бытии, что формирует основу дальнейшего философского исследования.