Сюжет не сосредотачивается на одной конкретной истории, а состоит из описаний различных случаев и ситуаций, возникающих в нейрохирургии — от экстренных вмешательств при травмах и опухолях до повседневных столкновений с бюрократией и организационными трудностями. Помещения больниц, условия работы и человеческие отношения представлены как часть среды, в которой разворачивается профессиональная деятельность героя. Он сталкивается со спецификой лечения сложных пациентов, иногда беременных женщин с рисковыми опухолями, а также с отсутствием однозначных ответов и профессиональных стандартов. Эти обстоятельства делают выбор хирургического вмешательства сложным и неоднозначным.

Усложнение ситуации происходит из-за постоянного противостояния между техническими возможностями и моральными ограничениями профессии. Герой испытывает давление, связанное как с ожиданиями окружающих, так и с собственными сомнениями по поводу оправданности операций и результатов лечения. Сложности усиливаются отсутствием точных прогнозов и высоким риском последствий как для пациентов, так и для врачей. Непростым становится и вопрос поддержки пациентов после операции — зачастую хирурги не имеют возможности наблюдать за дальнейшей судьбой тех, кого оперируют, что влияет на оценку их работы и принимаемых решений.

На фоне описанных проблем главная тема книги — дилемма между желанием спасти жизнь и необходимостью не навредить, то есть находить баланс между активным лечением и осторожностью, связанной с ограничениями человеческих возможностей. Работа героя требует постоянного пересмотра подходов, умения признавать ошибки и принимать сложные решения в условиях неопределённости. Развитие описываемых событий ведёт к осознанию, что нейрохирургия — это не только ремесло и наука, но и область, где личный выбор врача имеет критическое значение для судьбы пациентов и отражает фундаментальные вопросы этики и профессиональной ответственности. Такая ситуация остаётся центральной задачей на протяжении всего повествования книги Не навреди. Истории о жизни, смерти и нейрохирургии автора Генри Марш, Иван Г. Чорный.