Развитие сюжета связано с подготовкой к очередной операции, которую осложняет появление опасных магических существ и необходимость налаживания контакта с волшебниками с другой стороны границы. Улисса сталкивается с трудностями в убеждении военных, что есть альтернативные способы вести бой и что её роль гораздо значимее, чем просто «красивое дополнение» или «скептик». Её фамильяр, чёрный кот с некоторыми магическими возможностями, сопровождает и помогает в подготовке, а также в разведывательных задачах. На передовой и в лагере обостряется атмосфера, когда выясняется, что некоторые артефакты и магические средства оказались утеряны или похищены, что угрожает безопасности операции.

Внутренние и внешние препятствия, включая ограничения в использовании оружия и магии, отсутствие полного доверия между военными и магами, а также опасность неизвестного врага за границей, создают сложный контекст для действий главной героини. Улиссе приходится выбирать между продолжением традиционных методов и внедрением нестандартных подходов, рискованных, но потенциально эффективных. Вместе с тем, её беспокойство о безопасности и сомнения в успехе отражают масштаб задачи, стоящей перед ней и её союзниками. Решения, которые принимает Улисса, приводят к дальнейшему усложнению отношений с командованием, но открывают новые возможности для обхода противника.

Книжный сюжет сосредоточен на соотношении власти и магии, сплетается с военной тактикой и формирует дилемму о том, насколько можно доверять и полагаться на необычные умения в условиях войны. Центральным остаётся вопрос о том, смогут ли военачальник и ведьма найти общий язык и объединить усилия для достижения цели, а также какие риски придётся принять, чтобы прорвать вражескую оборону. «Заноза для военачальника» Татьяны Антоник повествует о том, как изменяется расклад сил и восприятие сторонников и противников в результате этих событий.