Развитие сюжета начинается с момента взрыва и связанных с ним последствий, вызывающих разногласия и подозрения среди местных жителей, которые относятся к пришельцам как к чужакам и потенциальным угрозам. Попытки объяснить природу происшествия на чужом языке, а также выяснить причины и объемы нанесенного ущерба, становятся отправной точкой для дальнейших действий. Поставленная задача — найти способы использования наличных природных ресурсов для восстановления хотя бы минимального уровня технологического прогресса, в том числе разработка пороха и попытки создания адаптированных вариантов вооружения и освещения.

Сложности усугубляются тем, что местная среда и биологические особенности обитателей резко отличаются от знакомых условий, что требует от главных героев постоянно адаптироваться, менять тактику и искать новые решения. Внешний фактор угрозы проявляется также в напряжении и недоверии между группами, а внутренний — в ограниченных ресурсах, недостатке времени и неготовности к резким изменениям. Ощущение чуждости и необходимость наладить контакт осложняют обеспечение безопасности и организацию жизни группы.

Представителям института приходится балансировать между поддержанием авторитета перед местными жителями и решением бытовых и технических проблем. Им приходится проявлять инициативу в поиске сырья, новых технологий на основе имеющихся знаний и интеграции с местным населением, которое не всегда воспринимает их доброжелательно. Сложный выбор между применением огневой силы и поиском компромиссов с аборигенами отражает основной конфликт, разыгрывающийся на фоне борьбы за выживание и сохранение человеческого общества вне привычных условий.

По мере развития событий становится ясно, что главная задача — выжить и адаптироваться в новой реальности, используя как прежние знания, так и местные особенности. Главный вопрос, остающийся в центре сюжета, — каким образом сохранить человечность, безопасность и дальнейшее развитие при ограниченных ресурсах и многочисленных угрозах извне и изнутри. Эта дилемма формирует основной вектор повествования и задает тон последующим решениям и изменениям в положении героев. В описании книги Новые конкистадоры авторы Владимир Мясоедов, Андрей Уланов освещают ситуацию, где старые представления о контроле и власти сталкиваются с суровой необходимостью приспособления и выживания в чуждом мире.