Развитие сюжета осложняется тем, что враги используют машину времени целенаправленно как средство массового поражения, что предъявляет к героям повышенные требования как к тактической подготовке, так и к стратегическому мышлению. Вмешательство в прошлое обязательно сопровождается неопределённостью и необходимостью обходить или нейтрализовать многочисленные ловушки и непредвиденные последствия. Эти обстоятельства вынуждают диверсантов принимать сложные решения и действовать не только быстро, но и с учётом возможных рисков для всего временного континуума.

Обострение конфликта происходит именно из-за того, что каждая миссия становится повторным испытанием реальности, где меняется представление о стабильности исторического процесса. Герои вынуждены применять полученный опыт, чтобы предотвратить исходы, угрожающие развитию страны и сохранению нормального исторического порядка. Их действия нацелены на сохранение структуры прошлого и недопущение превращения русской истории в череду бесконечных смут, революций и катастроф.

Основное напряжение сюжета связано с постоянным выбором между риском и необходимостью вмешательства, а также с необходимостью противостоять могущественным хронокарателям, которые стремятся изменить прошлое в своих интересах. Итогом их борьбы становится попытка сохранить историческую целостность и оберечь будущее от разрушительных изменений, сохранив при этом понимание того, что каждое вмешательство в ход истории — это серьёзная ответственность и серьёзное испытание.

Такое развитие событий и конфликтов образует основную тему произведения, задачу и дилемму, вокруг которой строится повествование в Диверсанты времени. Трилогия Алексея Михайловича Махрова.