Ситуация усложняется внутренними сомнениями и противоречиями в группе, а также дополнительными препятствиями, такими как непонятные движения объектов вне их контроля (например, появление и поведение кошки), не до конца ясные связи с окружающим миром и неопределённость в действиях создателей локаций. Возникает необходимость балансировать между реализмом восприятия и моделями, которые формируют эти пространства, а также принимать во внимание мнение различных участников, включая тех, кто уже ушёл или сменил позицию по проекту «Лазарь». Герои вынуждены принимать решения о продолжении работы, разведке новых возможностей и взаимодействии с другими силами, контролирующими события.

В процессе развития сюжета поднимается вопрос о соотношении теории и практики, о том, насколько можно доверять интеллектуальным моделям и системам, и какую роль играют человеческие эмоции и критика внутри команды. Ит и его окружение приходят к пониманию, что без чёткого руководства и ясных объяснений сложно продолжать движение вперёд. Однако они продолжают исследовать пространство, искать признаки жизни и ресурсы, например, обнаруживают неожиданно появившуюся голубику, что даёт им кратковременное облегчение и ощущение прогресса.

В центре истории остаётся дилемма между верой в теоретические построения и необходимостью принимать реальные, иногда противоречивые факты, а также вопрос о том, как сохранить мотивацию и единство в группе, сталкивающейся с загадками и неопределённостью. Ит принимает решение двигаться дальше, несмотря на сомнения, чтобы исполнить задачи, поставленные перед ним и его товарищами. В этом же заключается и главная тема книги — поиск смысла и структурирования в сложной, изменчивой реальности, которая представляет собой сочетание технологических и психологических вызовов.

Так развивается сюжет Атман, книга первая Екатерины Белецкой, в котором через взаимодействие героев с загадочным пространством и внутренние дискуссии раскрываются вопросы контроля, ответственности и выбора.