В процессе повествования появляется множество эпизодов, раскрывающих острые социальные и моральные проблемы, включая несправедливость, хитрость, предательство и сложности взросления в непростом обществе. Сложность ситуации обостряется из-за окружающих обстоятельств: противостояния между разными социальными группами, внутренней неспособности главных действующих лиц найти общий язык и сохранить справедливость. Буратино приходится принимать решения, направленные на защиту себя и своих интересов, несмотря на ограничения и давление со стороны более сильных или влиятельных персонажей.

Выборы героя связаны с необходимостью совмещать наблюдение и активные действия, и в этом взаимодействии с обстоятельствами формируется его характер и жизненная позиция. Конфликты, возникшие из-за непонимания и социального противостояния, приводят к постепенному изменению положения Буратино, расширению знаний о мире и влиянии тех, кто находится у власти или пытается её захватить. Центральной темой остаётся задача понимания и противостояния несправедливости, дилемма между порядочностью и хитростью в поведении, а также поиск своего места в сложном и неоднозначном мире взрослых и сверстников. В книге Бориса Конофальского «Буратино. Правда и вымысел…» рассматриваются как реальные обстоятельства жизни героя, так и исторические предпосылки, задающие основу его судьбы.