Развитие сюжета связано с попытками Климова создать эффективную систему правоохранения и управления, включая создание специального органа внутреннего надзора и реформирование прокуратуры и суда. Он стремится обучить новых сотрудников полиции и организовать работу детективов и сил специальных назначений для борьбы с преступностью. Одновременно ему приходится учитывать внутренние противоречия: отсутствие достаточного опыта у новых милиционеров, необходимость баланса между мерами наказания и возможностью для преступников возвращаться к честной жизни, а также политическую напряжённость между большевиками, меньшевиками и другими силами. Климов сталкивается с дилеммой, как поддерживать порядок, не допуская излишней жестокости и не утеряв при этом доверия людей.

Этот период сопровождается многочисленными конфликтами и препятствиями: присутствие вооружённых отрядов, желание криминальных элементов сохранить влияние, национализация предприятий и ухудшение условий жизни из-за голода и болезней. Несмотря на это, Климов старается удержать под контролем созданные им структуры и избежать дальнейшего развала. Его решения концентрируются на необходимости сохранить профессионализм и дисциплину, привлечь специалистов различных направлений, в том числе в медицине и науке, а также вести переговоры с влиятельными фигурами, чтобы обеспечить поддержку армии и производства. В процессе борьбы за порядок он сталкивается с жестокостью и предательством, а также с необходимостью выбрать между гуманностью и жёсткими мерами.

Развитие конфликта в книге отражает центральную задачу — удержать организацию и государственные структуры в трудных условиях, когда привычный порядок нарушен, а множество сторон пытаются диктовать свои правила. Михаил Климов вынужден балансировать между военной дисциплиной, политическими реалиями и социальной нестабильностью, что оказывает влияние на судьбы города и людей. Действия и решения, принимаемые им и его окружением, формируют основу для сохранения возможностей сопротивления большевистским силам и подготовки к дальнейшим событиям, связанным с гражданской войной и политическими преобразованиями. Тема борьбы за порядок и власть, а также вопрос, каким путём и ценой оно будет достигнуто, остаются главным фокусом развития сюжета.

Так складывается картина событий в произведении Георгия Лопатина, обозначившем основные противоречия и вызовы в условиях смуты, через призму усилий одного из участников борьбы за контроль и устойчивость в нарождающейся новой реальности. Экспедиционный корпус. Гражданская война концентрируется на столкновении интересов и необходимости поиска решений для сохранения организованности и управления в условиях революционного хаоса.