Развитие сюжета запускается переходом от изучения молекулярного уровня жизни, таких как молекулы РНК и белки, к более сложным формам, включая появление многоклеточных организмов, животных и в конечном итоге человека. Эволюция рассматривается как последовательность этапов, в которых постоянное взаимодействие случайных мутаций и целенаправленного отбора приводит к возникновению признаков, способствующих адаптации к условиям окружающей среды. В процессе раскрывается, что разум человека отчасти является результатом ускоренного и усложнённого варианта рациональности, которая изначально впервые появилась на уровне природы.

Проблемы, с которыми сталкивается исследователь, заключаются не только в выявлении этапов исторического развития, но и в преодолении ограничений традиционного восприятия эволюции как полностью случайного процесса. Требуется выделить роль неслучайного отбора, который постепенно формирует когнитивные способности и сложные формы жизни, не вводя при этом понятия сознательной преднамеренности организмов. Выделяется важность понимания, как из хаоса и случайных вариаций возникает упорядоченность, приводящая к появлению сознания как явления и способа восприятия мира.

Решения, к которым приходят в процессе исследования, связаны с необходимостью рассматривать эволюцию в терминах рациональности на уровне генов и популяций, когда выбор признаков происходит бессознательно, но последовательно и предсказуемо в масштабах многих поколений. Это позволяет более чётко осознать, что человеческий мозг и сознание — не мистические явления, а результат долгой истории адаптации и усложнения живых систем. Внимание также уделяется тому, как внутренние свойства памяти, восприятия и воли связаны с организацией молекулярных и биологических механизмов, что расширяет понимание живого как единого целого.

Развитие этой темы приводит к осознанию главной дилеммы: разделение мира на субъекта и объекта — привычное явление, но на самом деле границы между ними не всегда очевидны и могут быть условными. Этот вопрос остаётся ключевым для понимания человеческой природы и места разума в общем потоке жизни. Природа сознания и рациональности рассматривается как продолжение и сложное проявление тех же естественных процессов, которые наблюдались в безжизненных веществах, что отражает общий ход развития от простого к сложному. Книга направлена на систематизацию представлений о возникновении человеческого разума через призму эволюции и биологии, предлагая взгляд, в котором человек — часть природы, а разум — её свойство, возникшее в долгом процессе изменений.

Таким образом, центральной темой выступает поиск взаимосвязей между неживой природой, жизнью и сознанием, а также понимание механизмов, которые привели к появлению человеческого разума как особого явления в природе. Все эти вопросы сосредоточены вокруг необходимости понять эволюционные принципы, которые, будучи нисколько не преднамеренными на уровне организмов, приводят к высокоорганизованным и адаптивным системам, включая мозг и сознание человека.

Николай Кукушкин посвящает внимание роли естественного отбора и наследственности, подчеркивая, что рациональность природы и человеческого мозга — единое явление, возникшее в ходе миллиарды лет истории жизни. Это рассмотрение позволяет осмыслить и объяснить человеческий разум как итог сложного природного процесса, лишенного сознательной направленности, но ведущего к появлению высших форм организации и мышления. Таким образом раскрывается комплексная связь между эволюцией в широком биологическом смысле и особенностями человеческого сознания. Книга Хлопок одной ладонью: Как неживая природа породила человеческий разум отражает важные вопросы нейробиологии, биологии и эволюционной антропологии без привлечения посторонних допущений.